Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms