Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAM1Q96QH2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRAM1Q96QH2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PRAM1Q96QH2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRAM1Q96QH2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRAM1Q96QH2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRAM1Q96QH2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRAM1Q96QH2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRAM1Q96QH2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRAM1Q96QH2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRAM1Q96QH2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRAM1Q96QH2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PRAM1Q96QH2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRAM1Q96QH2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRAM1Q96QH2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRAM1Q96QH2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRAM1Q96QH2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRAM1Q96QH2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRAM1Q96QH2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRAM1Q96QH2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PRAM1Q96QH2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms