Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms