Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG8Q96MW5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms