Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms