Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms