Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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