Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP12Q6UXS9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms