Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRAIDQ6UW56 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms