Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms