Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms