Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms