Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms