Protein–RNA interactions for Protein: Q4W5G0

TIGD2, Tigger transposable element-derived protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD2Q4W5G0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIGD2Q4W5G0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIGD2Q4W5G0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms