Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KNOP1Q1ED39 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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