Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDO1Q16878 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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