Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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