Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF1Q15637 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF1Q15637 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF1Q15637 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF1Q15637 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF1Q15637 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF1Q15637 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SF1Q15637 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF1Q15637 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF1Q15637 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF1Q15637 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF1Q15637 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF1Q15637 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF1Q15637 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF1Q15637 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF1Q15637 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF1Q15637 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF1Q15637 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF1Q15637 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF1Q15637 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF1Q15637 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF1Q15637 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF1Q15637 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF1Q15637 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF1Q15637 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF1Q15637 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF1Q15637 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF1Q15637 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF1Q15637 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF1Q15637 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF1Q15637 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF1Q15637 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF1Q15637 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF1Q15637 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF1Q15637 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF1Q15637 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF1Q15637 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SF1Q15637 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SF1Q15637 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SF1Q15637 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SF1Q15637 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF1Q15637 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF1Q15637 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF1Q15637 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF1Q15637 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SF1Q15637 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF1Q15637 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF1Q15637 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF1Q15637 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF1Q15637 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SF1Q15637 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SF1Q15637 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF1Q15637 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF1Q15637 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF1Q15637 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF1Q15637 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF1Q15637 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF1Q15637 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF1Q15637 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF1Q15637 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF1Q15637 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF1Q15637 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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