Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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