Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms