Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF85Q03923 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF85Q03923 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms