Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms