Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS25P62851 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS25P62851 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS25P62851 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS25P62851 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPS25P62851 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
RPS25P62851 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPS25P62851 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPS25P62851 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPS25P62851 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPS25P62851 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPS25P62851 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS25P62851 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS25P62851 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS25P62851 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS25P62851 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS25P62851 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS25P62851 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS25P62851 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS25P62851 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS25P62851 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS25P62851 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS25P62851 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS25P62851 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS25P62851 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS25P62851 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS25P62851 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS25P62851 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS25P62851 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS25P62851 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS25P62851 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS25P62851 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS25P62851 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS25P62851 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS25P62851 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS25P62851 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS25P62851 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS25P62851 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS25P62851 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS25P62851 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS25P62851 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS25P62851 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS25P62851 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS25P62851 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS25P62851 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms