Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE1P56817 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE1P56817 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE1P56817 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE1P56817 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE1P56817 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE1P56817 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE1P56817 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE1P56817 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE1P56817 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE1P56817 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE1P56817 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BACE1P56817 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BACE1P56817 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BACE1P56817 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BACE1P56817 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BACE1P56817 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BACE1P56817 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BACE1P56817 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BACE1P56817 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BACE1P56817 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BACE1P56817 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BACE1P56817 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BACE1P56817 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BACE1P56817 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BACE1P56817 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BACE1P56817 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BACE1P56817 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BACE1P56817 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BACE1P56817 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BACE1P56817 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BACE1P56817 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BACE1P56817 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BACE1P56817 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BACE1P56817 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BACE1P56817 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BACE1P56817 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BACE1P56817 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BACE1P56817 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BACE1P56817 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BACE1P56817 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BACE1P56817 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BACE1P56817 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BACE1P56817 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BACE1P56817 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BACE1P56817 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BACE1P56817 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BACE1P56817 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BACE1P56817 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BACE1P56817 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BACE1P56817 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BACE1P56817 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BACE1P56817 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BACE1P56817 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BACE1P56817 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BACE1P56817 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BACE1P56817 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BACE1P56817 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BACE1P56817 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BACE1P56817 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BACE1P56817 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BACE1P56817 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BACE1P56817 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BACE1P56817 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BACE1P56817 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BACE1P56817 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BACE1P56817 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BACE1P56817 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BACE1P56817 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BACE1P56817 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BACE1P56817 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BACE1P56817 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BACE1P56817 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BACE1P56817 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BACE1P56817 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BACE1P56817 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BACE1P56817 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BACE1P56817 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BACE1P56817 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BACE1P56817 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BACE1P56817 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BACE1P56817 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BACE1P56817 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BACE1P56817 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BACE1P56817 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BACE1P56817 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BACE1P56817 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BACE1P56817 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BACE1P56817 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BACE1P56817 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BACE1P56817 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BACE1P56817 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BACE1P56817 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BACE1P56817 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BACE1P56817 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BACE1P56817 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BACE1P56817 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BACE1P56817 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BACE1P56817 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BACE1P56817 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms