Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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RAB5CP51148 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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RAB5CP51148 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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RAB5CP51148 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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RAB5CP51148 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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RAB5CP51148 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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RAB5CP51148 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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RAB5CP51148 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RAB5CP51148 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RAB5CP51148 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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