Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMLP26374 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMLP26374 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMLP26374 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMLP26374 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMLP26374 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMLP26374 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMLP26374 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMLP26374 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMLP26374 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMLP26374 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMLP26374 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMLP26374 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMLP26374 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMLP26374 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMLP26374 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMLP26374 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMLP26374 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMLP26374 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMLP26374 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMLP26374 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMLP26374 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMLP26374 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMLP26374 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMLP26374 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMLP26374 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMLP26374 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMLP26374 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMLP26374 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMLP26374 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMLP26374 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMLP26374 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMLP26374 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMLP26374 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMLP26374 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMLP26374 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMLP26374 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMLP26374 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMLP26374 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMLP26374 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMLP26374 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMLP26374 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMLP26374 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMLP26374 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMLP26374 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMLP26374 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMLP26374 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMLP26374 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMLP26374 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMLP26374 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMLP26374 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMLP26374 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMLP26374 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMLP26374 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMLP26374 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMLP26374 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMLP26374 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMLP26374 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMLP26374 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMLP26374 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMLP26374 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMLP26374 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMLP26374 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMLP26374 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMLP26374 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMLP26374 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMLP26374 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMLP26374 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMLP26374 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMLP26374 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMLP26374 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMLP26374 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMLP26374 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMLP26374 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMLP26374 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMLP26374 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMLP26374 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMLP26374 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMLP26374 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMLP26374 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMLP26374 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMLP26374 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms