Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms