Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GADD45AP24522 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GADD45AP24522 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GADD45AP24522 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GADD45AP24522 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GADD45AP24522 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GADD45AP24522 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GADD45AP24522 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GADD45AP24522 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GADD45AP24522 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GADD45AP24522 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GADD45AP24522 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GADD45AP24522 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GADD45AP24522 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GADD45AP24522 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GADD45AP24522 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms