Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms