Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms