Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00869P0C866 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms