Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERPIND1P05546 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERPIND1P05546 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms