Protein–RNA interactions for Protein: P01880

IGHD, Immunoglobulin heavy constant delta, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHDP01880 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGHDP01880 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IGHDP01880 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IGHDP01880 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGHDP01880 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGHDP01880 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGHDP01880 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGHDP01880 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGHDP01880 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGHDP01880 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGHDP01880 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGHDP01880 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGHDP01880 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGHDP01880 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHDP01880 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHDP01880 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHDP01880 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHDP01880 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHDP01880 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHDP01880 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHDP01880 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHDP01880 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHDP01880 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHDP01880 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHDP01880 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHDP01880 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHDP01880 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHDP01880 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHDP01880 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHDP01880 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHDP01880 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHDP01880 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHDP01880 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHDP01880 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHDP01880 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHDP01880 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHDP01880 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHDP01880 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHDP01880 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHDP01880 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHDP01880 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHDP01880 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHDP01880 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHDP01880 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHDP01880 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHDP01880 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHDP01880 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHDP01880 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHDP01880 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHDP01880 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHDP01880 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHDP01880 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHDP01880 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHDP01880 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHDP01880 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHDP01880 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHDP01880 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHDP01880 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHDP01880 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHDP01880 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHDP01880 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHDP01880 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHDP01880 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHDP01880 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHDP01880 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHDP01880 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHDP01880 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHDP01880 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHDP01880 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHDP01880 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHDP01880 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHDP01880 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHDP01880 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHDP01880 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms