Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms