Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms