Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGR2O43760 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms