Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTIFO43310 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTIFO43310 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTIFO43310 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTIFO43310 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTIFO43310 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTIFO43310 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTIFO43310 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTIFO43310 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTIFO43310 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTIFO43310 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTIFO43310 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTIFO43310 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTIFO43310 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTIFO43310 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTIFO43310 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTIFO43310 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTIFO43310 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTIFO43310 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTIFO43310 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTIFO43310 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTIFO43310 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTIFO43310 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTIFO43310 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTIFO43310 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTIFO43310 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CTIFO43310 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CTIFO43310 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTIFO43310 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTIFO43310 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTIFO43310 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTIFO43310 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTIFO43310 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTIFO43310 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTIFO43310 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CTIFO43310 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTIFO43310 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTIFO43310 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTIFO43310 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTIFO43310 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTIFO43310 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTIFO43310 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTIFO43310 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTIFO43310 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTIFO43310 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTIFO43310 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTIFO43310 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTIFO43310 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTIFO43310 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTIFO43310 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTIFO43310 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTIFO43310 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CTIFO43310 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTIFO43310 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTIFO43310 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTIFO43310 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTIFO43310 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTIFO43310 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTIFO43310 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CTIFO43310 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
CTIFO43310 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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