Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms