Protein–RNA interactions for Protein: V9GYH0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYH0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYH0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYH0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYH0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYH0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYH0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYH0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYH0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYH0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYH0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYH0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYH0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYH0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYH0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYH0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYH0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYH0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYH0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYH0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYH0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYH0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYH0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYH0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYH0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYH0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYH0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYH0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYH0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYH0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYH0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYH0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYH0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYH0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYH0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYH0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
V9GYH0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
V9GYH0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
V9GYH0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
V9GYH0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
V9GYH0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms