Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms