Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP1Q9UPQ3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms