Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms