Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MBD5Q9P267 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MBD5Q9P267 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms