Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms