Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MSRB1Q9NZV6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms