Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NINJ2Q9NZG7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NINJ2Q9NZG7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NINJ2Q9NZG7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NINJ2Q9NZG7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms