Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPRMQ9NS64 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms