Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 CBFA2T3-205ENST00000563856 2380 ntTSL 218.1■□□□□ 0.495e-6■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 CBFA2T3-208ENST00000566868 284 ntTSL 510.69□□□□□ -0.75e-6■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.165e-6■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 B3GNTL1-210ENST00000573629 423 ntTSL 38.86□□□□□ -0.992e-6■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 ZMYND8-202ENST00000311275 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.713e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 ZMYND8-217ENST00000536340 5273 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.783e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 ZMYND8-205ENST00000360911 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.873e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 ZMYND8-204ENST00000355972 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.933e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 ZMYND8-220ENST00000617418 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.953e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 ZMYND8-218ENST00000540497 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.013e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.083e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.13e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.113e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 ZMYND8-213ENST00000461685 3567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.143e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.143e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.183e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.183e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.23e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.223e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.273e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.311e-6■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 LRP1-207ENST00000554174 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.641e-6■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 LRP1-202ENST00000338962 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.821e-6■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.031e-6■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 AL136531.2-201ENST00000618770 1164 ntTSL 217.27■□□□□ 0.364e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.014e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.381e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 AMN-202ENST00000541086 2269 ntTSL 220.78■□□□□ 0.921e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 CERS4-203ENST00000558268 713 ntTSL 323.55■■□□□ 1.361e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.771e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.681e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.651e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 CERS4-213ENST00000561053 768 ntTSL 518.17■□□□□ 0.51e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 CERS4-214ENST00000595722 1826 ntTSL 1 (best)17.91■□□□□ 0.461e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.391e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 CERS4-206ENST00000558501 873 ntTSL 516.82■□□□□ 0.281e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 CERS4-211ENST00000560412 568 ntTSL 416.06■□□□□ 0.161e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 CERS4-212ENST00000561008 531 ntTSL 414.5□□□□□ -0.091e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 NFIC-207ENST00000589164 435 ntTSL 311.71□□□□□ -0.538e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 XPO1-207ENST00000436018 318 ntTSL 44.9□□□□□ -1.632e-17■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.48e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 KMT2A-209ENST00000531904 4320 ntTSL 217.74■□□□□ 0.432e-8■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 KMT2A-206ENST00000527869 481 ntTSL 317■□□□□ 0.312e-8■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 KMT2A-211ENST00000533790 804 ntTSL 217■□□□□ 0.312e-8■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 KMT2A-208ENST00000529852 3323 ntTSL 211.27□□□□□ -0.612e-8■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.612e-8■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.162e-8■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 PRKCZ-219ENST00000484419 519 ntTSL 223.1■■□□□ 1.291e-6■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 TMC6-209ENST00000588087 2384 ntTSL 219.68■□□□□ 0.746e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.666e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 TMC6-210ENST00000588792 843 ntTSL 216.98■□□□□ 0.316e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 TMC6-211ENST00000589271 1099 ntTSL 515.77■□□□□ 0.126e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 TMC6-205ENST00000586126 821 ntTSL 315.5■□□□□ 0.076e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 TMC6-223ENST00000592594 551 ntTSL 415.11■□□□□ 0.016e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 PRKCZ-224ENST00000503297 468 ntTSL 514.78□□□□□ -0.041e-6■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 TMC6-207ENST00000586697 571 ntTSL 413.87□□□□□ -0.196e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 TMC6-221ENST00000592063 743 ntTSL 513.26□□□□□ -0.296e-10■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-204ENST00000471129 900 ntTSL 316.18■□□□□ 0.187e-8■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.177e-8■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.247e-8■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.37e-8■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.547e-8■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.324e-11■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 TJP3-206ENST00000587912 721 ntTSL 320.64■□□□□ 0.897e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.854e-11■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.834e-11■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.574e-11■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.274e-11■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.277e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.224e-11■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.074e-11■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.137e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.197e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 TJP3-208ENST00000590545 580 ntTSL 313.05□□□□□ -0.327e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.364e-19■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 RPS6KA3-202ENST00000438357 530 ntTSL 514.11□□□□□ -0.154e-19■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.825e-6■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.485e-6■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.335e-6■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.719e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 NCAPG2-205ENST00000441982 2926 ntTSL 28.81□□□□□ -19e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 NCAPG2-204ENST00000432615 4134 ntTSL 58.41□□□□□ -1.069e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 NCAPG2-203ENST00000409423 3957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.099e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 NCAPG2-206ENST00000467785 3276 ntTSL 1 (best)7.32□□□□□ -1.249e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.349e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 CBX8-203ENST00000427800 665 ntTSL 218.14■□□□□ 0.492e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 CBX8-204ENST00000485449 581 ntTSL 318.06■□□□□ 0.482e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 CBX8-202ENST00000413392 777 ntTSL 315.99■□□□□ 0.152e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 TRADD-203ENST00000563348 833 ntTSL 217.83■□□□□ 0.443e-8■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.562e-6■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.151e-6■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.361e-6■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 KDM4B-207ENST00000588961 560 ntTSL 47.91□□□□□ -1.147e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.897e-9■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 RAB40B-207ENST00000572603 451 ntTSL 220.31■□□□□ 0.847e-9■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.077e-9■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.157e-9■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.778e-7■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.421e-9■■■■□ 20
CSTF2TQ9H0L4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 19.9
Retrieved 100 of 19,151 protein–RNA pairs in 166.3 ms