Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN1Q9GZU1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms