Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
YTHDC1Q96MU7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms